สำนัก/สถาบันสำนักวิทยบริการ
สำนักคอมพิวเตอร์
สำนักบริการวิชาการ
สถาบันวิจัยศิลปะและวัฒนธรรมอีสาน
สถาบันวิจัยวลัยรุกขเวช
สถาบันขงจื๊อ
สำนักงานอธิการบดี
กองกลาง
งานประชาสัมพันธ์
งานวิเทศสัมพันธ์
งานการประชุม
งานสัมพันธ์ศิษย์เก่า
กองแผนงาน
กองการเจ้าหน้าที่
กองกิจการนิสิต
งานหอพักนิสิต
กองทุนกู้ยืมเพื่อการศึกษา
กองคลังและพัสดุ
กองบริการการศึกษา
กองทะเบียนและประมวลผล
กองส่งเสริมและพัฒนางานวิจัย
กองอาคารสถานที่
สำนักงานป้องกันและปราบปรามการทุจริตต่อหน้าที่
พิพิธภัณฑ์มหาวิทยาลัยมหาสารคาม
สภาคณาจารย์
หน่วยตรวจสอบภายใน
ศูนย์ฝึกอบรมศาสตร์และศิลป์การเรียนรู้ทางการศึกษา
อาคารชุดที่พักอาศัยบุคลากร
[แก้] โรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยมหาสารคามโรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยมหาสารคาม ปัจจุบันโรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยมหาสารคาม เป็นหน่วยงานขึ้นตรงต่อ สำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยมหาสารคาม และเป็นโรงเรียนสาธิตเพียงแห่งเดียวในประเทศไทยที่ไม่ได้สังกัดคณะศึกษาศาสตตั้งอยู่ 2 แห่งภายในมหาวิทยาลัยมหาสารคาม ได้แก่

โรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยมหาสารคาม(ฝ่ายประถม)
โรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยมหาสารคาม(ฝ่ายมัธยม)